吴忠历史渊源流长，公元前2.5万年左右，先民就在这里劳动、生息。秦时于今盐池县境内首设昫衍县，大约辖原银南地区全境。秦始皇三十三年（前214），境内设富平县，为宁夏平原最早设置的县。此后分别置灵州、回乐等县郡。清朝置宁朔县，县署治小坝堡；置平远县，县署下马关。民国二年（1913）成立盐池县，隶朔方道。1936年3月，成立盐池县苏维埃政府和陕甘宁省豫海县回民自治政府。1949年9月吴忠全境解放，成立吴忠堡市，由宁夏省直辖；11月缩编为吴忠镇，归灵武县管辖。同年9月，同心县成立。1950年10月吴忠镇正式改为吴忠市，宁夏省直辖。1954年4月，宁夏省河东回族自治区成立， 辖金积、 灵武、吴忠、同心四县市（1955年4月代管盐池县，12月正式管辖），并与吴忠市人民政府合署办公。9月，宁夏省建置撤销，河东回族自治区隶属甘肃省。1955年2月１日，河东回族自治区人民政府与吴忠市人民政府分署办公。4月28日，河东回族自治区更名为吴忠回族自治州。1958年10月25日，宁夏回族自治区成立，自治州撤销，吴忠市直属宁夏回族自治区。1953年4月至1958年10月设立吴忠回族自治州，辖吴忠、金积、灵武、同心、盐池。1960年，撤销金积县，撤宁朔县改名为青铜峡市。1963年撤销吴忠市、青铜峡市设立吴忠县和青铜峡县。1972年2月23日国务院批准设立银南地区革命委员会，1973年4月设立银南行政公署，属自治区派出机构。1984年撤销吴忠县、青铜峡县恢复吴忠市、青铜峡市。1998年5月撤销银南地区和县级吴忠市，设立地级吴忠市，县级吴忠市改称利通区。地级市辖利通区、青铜峡市、灵武市、中卫县、中宁县、盐池县、同心县。1998年9月5日，成立县级红寺堡开发区。2002年10月灵武市划归银川市代管，2003年12月，中卫县、中宁县划归新设立的地级中卫市。2009年10月，红寺堡开发区设区。同月，利通区分署办公。吴忠市现辖利通区、红寺堡区、青铜峡市、盐池县、同心县